Църква на Сан Франческо Гаета е основана от последователи на св. Франциск от Асизи в 1222 г., годината. Нейните строителни щедри парични дарения подкрепен крал Чарлз II на Anjou династия, която бе посветена на предписанията на Свети Франциск. Огромният готическата църква е завършена през 14-ти век. Той се състои от централен кораб с високи арки, двете долни крила, квадратна иконостас и едноабсидна в края. Подобно на много други църкви Гаета, San Francesco е украсена с произведения на изкуството, между 16-ти и 18-ти век. Вътре са погребани някои от членовете на аристократичните семейства в града и членовете на неговия испански правителство.

След нахлуването на полуострова на Наполеон, който е издал указ за разпускане на религиозни ордени и затварянето на църкви и манастири, църквата Сан Франческо започва да намалява. Дори и след като работата по възстановяване на извършени 1854-1858-ти-те години под ръководството на арх Guarinelli, храмът е бил изоставен за известно време. Следва да се отбележи, че възстановяването на San Francesco е проведено под патронажа на италианския кралското семейство, и в нея участваха същите майстори, които са работили на църквата Сан Франческо ди Паола в Неапол.

Small щети на сградата на църквата е било направено в бурните 1860 г., когато е бил на процеса на обединението на Италия, както и по време на Втората световна война, на Сан Франческо претърпял много по-значимо. Следните възстановителните работи са извършени в 1951-52-т съответно.

За да стигнете до църквата може да бъде по стълбите, в горната част на която, затворена от парапети, е паметник и който предлага един велик оглед на Гаета и залива. В центъра на фасадата е голям портал с мраморни статуи от двете страни - Чарлз II на Неапол и Фердинанд II. На тимпан виждал алегория на възстановяването на папството, и се оставя на статуите на светиите Бернар, Ambrose, Францис, Августин и Тома Аквински. Отвътре църквата са огромни гипсови статуи на апостолите, и отгоре на апсидата - Христос Спасителя. Украсата на San Francesco е високия олтар, проектирана от Guarinelli, както и няколко картини, изобразяващи светци и библейски сцени.

В ляво на църквата е построена дадена сграда, която някога е била манастир. Той запазена обител на 14 век. Обширна двор служи като платформа за останалата част, която е дори футболно игрище.