Православната църква Свети Николай е основана в Лион от представители на руската общност, които бяха емигрира във Франция след революцията 1917.

Първата църква, основана през 1928 г., който се помещава в дървена сграда на улица Drum. Той е кръстен на известния светеца, както и паметта на изстрела, заедно със семейството на император Николай II. Първият ректор е баща на Виктор (Пушкин), бивш полкови свещеник.

През 1937 г. храмът е вероятно се дължи на палеж, изгоря напълно. Оползотворяване му започна само две години по-късно - за изграждането на мача ново място на Rue Saint-Женевиев каменна сграда. Temple създаден емигранта на проекта Сергей Bazdereva. Строежът на църквата е била извършена от ректора и енориаши събраха на дарения, работата е извършена през вечерите и в почивните дни, така че строителството продължи много бавно. Дори по време на Втората световна война, въпреки бомбардировките и липсата на средства, работата продължава. И вътрешността на храма продължи дори и след края на войната. Освещаването на църквата се състоя май 1946.

През 1970 г. в църквата след падането на тавана е ремонтирана. Към края на миналия век, около църквата до тези квартали, а когато до него е открит метростанция, броят на поклонниците увеличава. Една от иконите на църквата, посветена на Св Ириней - епископ на Лион бяха мъченически за вярата си в 202 година.

Църква Свети Никола в Лион богата украса е различна и оригинална архитектура, но тя се нарича паметника на първата вълна на емиграция и символ на любовта на православната вяра.

В Лион, има и други руски православни църкви - например, църквата Свети Йоан руснакът.