Обиколка на парка Уено води задължително гост на японската столица в Националния музей на природата и науката, който се намира в североизточната част на парка. Експозицията включва над 14 хиляди експоната и говори за произхода на света като цяло и в частност на японския архипелаг, както и за промените, които са настъпили в историята си от началото до наши дни.

Музеят е открит през 1871 г. и оттогава се е променила няколко имена - това е на Министерството на образованието и Музей, Музей и Токио, докато през 2007 г. не е придобило сегашното си име. В края на двадесети век и началото на този век, музеят е преминал през модернизация. Нейната основна сграда е обявена за културно наследство на нацията, сега е на японския галерията, има и 3D-кино "Theater 360". Новата сграда на музея е открита световна галерия. Преди да влезе в музея инсталиран фигура на синия кит в пълен размер.

Шест етажа на Global галерия говорят за еволюцията на живота на Земята, на законите на природата, произхода на динозаври и видовото разнообразие. Отделни раздели са посветени на развитието на науката и технологиите, както и представители на животинския свят. Градината се намира на покрива на галерията, издигащ се на около 160 вида лечебни и ароматни билки, а има и чадъри, които са разкрити в подхода на човека до тях. В галерията посетителите могат свободно да притежават или да получите физически опит в интерактивна дървен материал.

Японски галерия се намира в бившия основната сграда, построена през 1930 година. Ето какво беше японския архипелаг през ледниковия период, можете да видите колекция от минерали, фосили метеорити,, научете повече за животните, обитаващи островите на архипелага, за да разберете какви са земеделското оборудване с. Отделен раздел е посветен на ролята на ориз в живота на Япония.

3D-кино "Theater 360", който се намира в същата сграда, е предаден на музея след края на международното изложение "Експо-2005", където беше представен за първи път на посетителите на павилиона на Япония. Това сферична безпроблемно екран с диаметър от 12, 8 метра. Този размер е избрана: фигурата - около една милионна от диаметъра на нашата планета. Броят 360 в името на киното е ъгълът на видимост. Публиката в киното в центъра на сферата, и неговите куполни филмите проектирани върху произхода на Вселената, динозаврите и континентите. Четири от тях са създадени от екипа на музея.